我院成功开展肺癌高通量基因测序实验
2016-10-21 08:16 点击次数:
近期,我院肿瘤学实验室成功的在ABI新一代Ion Torrent高通量测序平台上开展非小细胞肺癌基因测序相关实验。这标志着我院成为重庆市首家具有自主高通量测序能力的三级甲等医院。
该批次实验在ION 314测序芯片上完成,涵盖了13个基因389种体细胞突变,包涵了单碱基突变、插入、缺失及基因融合突变等多种突变类型。样本包括肺癌组织标本和血浆标本。实验结果达到预期效果:ISP Loading 89%、on target 97.42%、总读数289302、可用读数62%、平均测序深度1344层、均一性95.82%、平均信号精确率99.3%。该批次检测结果与我院其他检测平台,例如ARMS-PCR、Sanger测序的结果保持一致。
人化操作基因组测序仪(PGM),配合革新性的Ion Torrent 的半导体芯片,反应试剂盒和计算机服务器,数据分析软件,使整个平台具有极高的扩展性和快速完成测序的性能,将为临床医生提供最尖端的快速、准确的测序解决方案。
通过前期合作开发,肿瘤学实验室将在肺癌、结直肠癌领域为临床提供高通量测序服务。基于Ion Torrent技术快速、便捷的检测特点,在满足最低4例检测标本的前提下,肺癌与结直肠癌标本高通量检测周期报告时间约为5个工作日,与此前的检测方法相比,检测时间大为缩短,这对于指导临床化疗药物选择,推动我院肿瘤个体化治疗方面有着积极的作用。
(肿瘤学实验室)